El responsable de la unidad de Bioinformática del
Centro cree que el uso de programas libres ofrece más posibilidades de
adaptación a tareas concretas
El Banco Nacional de ADN, situado en el Centro de Investigación del
Cáncer (USAL-CSIC) de la Universidad de Salamanca funcionará con software
libre gracias a un acuerdo con Sun Microsystems, que ya el año anterior
donó la plataforma para el proyecto del Genoma, por valor de 65.000
euros.
Gracias al acuerdo, los investigadores tienen a su disposición el software
libre de uso más común en aplicaciones de gestión, seguridad o trabajo
en Red, dentro del Sistema Operativo en plataforma Linux 'Java Desktop
System (JDS)'.
En el terreno de la bioinformática avanzada y servidores de
administración, los investigadores del Centro utilizan sistemas
GNU/Linux y plataformas LAMP. Asimismo, existen proyectos concretos
como ClusterBlast, un sistema distribuido de cálculo de alineamientos
de secuencias, y ProbeFinder, un navegador genómico que usan
tecnologías libres como URL o MING, las cuales permiten generar
gráficos vectoriales.
Diego Alonso, responsable de la unidad de Bioinformática del Centro, explica que el uso de software
libre ofrece más posibilidades de adaptación a tareas concretas: "La
ayuda que ofrecen las comunidades desarrolladoras de cada pieza de software
en forma de manuales, foros y comunicaciones directas con los autores
es inmediata, sin trabas ni aranceles. Además, el uso de licencias de
código libre es una forma justa de devolver a la comunidad el trabajo
que realizamos en un centro con fondos públicos".
Restos propietarios
Alonso reconoce que se siguen utilizando algunas aplicaciones de tipo
propietario. La gestión informática de las muestras del banco Nacional
de ADN se gestiona mediante una aplicación basada en .NET y SQL Server,
puesto que "había que respetar ciertos estándares establecidos
anteriormente". También la mayoría de los ordenadores y algún servidor
tienen instalados sistemas operativos propietarios (Windows, Mac OS,
Solaris). "Aún es difícil que todos los usuarios sin muchos
conocimientos informáticos se adapten a sistemas libres".
El Centro de Investigación del Cáncer se creó en 1997 siguiendo el
modelo norteamericano de integrar investigación competitiva y de
excelencia sobre cáncer en tres niveles distintos: básico, clínico y
aplicado.
Un resultado muy destacado ha sido la puesta en marcha, de un modelo de
investigación integral del cáncer que implica trabajo simultáneo y
coordinado, de manera que se facilita la información pública de los
resultados de la investigación sobre el cáncer.
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